Overlevenden van schipbreuk gevonden op het vermoedelijk onbewoonde Infant Island leiden tot een wetenschappelijke expeditie die een overlevende inheemse bevolking ontdekt, samen met de Shobijin, kleine tweeling feeën priesteressen van de mythische godheid van het eiland, Mothra genaamd. Nadat de feeën zijn ontvoerd door een uitbuitende zakenman genaamd Clark Nelson, gaat Mothra op pad om ze te redden.
Overlevenden van schipbreuk gevonden op het vermoedelijk onbewoonde Infant Island leiden tot een wetenschappelijke expeditie die een overlevende inheemse bevolking ontdekt, samen met de Shobijin, kleine tweeling feeën priesteressen van de mythische godheid van het eiland, Mothra genaamd. Nadat de feeën zijn ontvoerd door een uitbuitende zakenman genaamd Clark Nelson, gaat Mothra op pad om ze te redden.